Le dernier appel à projets Marco Polo II pour la période 2007-2013, lancé en mars 2013, a été finalisé par la décision de l'INEA en mai 2014 des projets à financer.

27 projets ont été jugés éligibles à recevoir le soutien financier de l'UE dans trois différentes catégories d'actions sur les cinq proposées :

• Report modal - 24 dont 15 en faveur du rail, 3 en faveur du shortsea, 2 en faveur du fluvial (également 1 rail+fluvial, 1 rail+shortsea, 1 shortsea+fluvial)
• Actions à effet catalyseur
• Autoroutes de la mer - 1  : le projet d'autoroute de la mer "Atlantica" entre Vigo et Nantes Saint-Nazaire
  
• Évitement de trafic
• Actions d’apprentissage en commun - 2 dont 1 en liaison avec le GNL comme carburant marin

La contribution financière de l'UE varie d'un maximum de 4,2 millions d'euros à un minimum d'environ 280 000 euros pour les projets de transfert modal de la route vers le rail et pour le partage de bonnes pratiques via, entres autres, les e-plateformes.

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